El CajalBBP es una ambiciosa iniciativa sobre la cual se ha creado el CCCL en 2009. Este proyecto es la representación española en el International Blue Brain Project (BBP). En mayo de 2009 el CajalBBP arrancó oficialmente en la Universidad Politécnica de Madrid (UPM). El BBP Internacional representa el primer intento global de ingeniería inversa en el cerebro de mamíferos con el fin de entender su funcionamiento y disfunciones mediante simulaciones detalladas.
CajalBBP se compone principalmente de: Neurociencia y Neuroinformática. El primero es la gestión de la CCCL y supone el núcleo del proyecto. El segundo está compuesto por cuatro módulos de la UPM (análisis de datos, visualización, procesamiento de imágenes y herramientas informáticas). Debido a su carácter multidisciplinar, estos componentes son apoyados por colaboradores externos de equipos nacionales (FECAN (IC-CSIC), Grupo de Modelado y realidad virtual (URJC), Instituto IMDEA Materiales, (ETSII-UPM), así como por grupos internacionales, como Columbia University (EE.UU.), la Universidad de Heidelberg (Alemania), Universidad de California (EE.UU.), y también varias entidades privadas (Artica, Zeiss).
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